Looking for a TATA Box... - (Sep/24/2009 )
Hello,
I am a new Ph.D. student in bioinformatics and my scientific background is mainly form computer sciences and not in biology or bioinformatics so I am sorry if my question is stupid.
My question is quite simple : Does someone have an example of a gene with its TATA Box ?
I have seen a lot of times that the TATA Box is located -35 to -25 bp from the Transcription Start Site:
https://www.biochem.northwestern.edu/holmgr...T/TATA_box.html
https://gpminer.mbc.nctu.edu.tw/help.php
But the problem is that I am not able to find this TATA Box (Or somethings that looks like a TATA Box) for all the genes that I have tried (about 50)...
Some examples (different genes), in different views (gene sequence views, transcript sequence views, location view):
https://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Transc...ENST00000431589
https://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/S...17695-133161157
https://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Locati...743372-84743444
I am working with the Human genome and I am using the ensembl genome viewer.
Thank you for your answers or any information that you can send to me!
Cosmo
You need to get the whole gene sequence, not only the transcript
CTTGCTGCAATGCTATGGGTTGTCCTTTGCTGTGCTATGAGATGGATGCAGAGGTCAGCT
GTGATCTCTGCCCTAGGGGAAACTCAAAGTCTAGAGGGGGAGACAGGCAAGCTCACAGAA
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GGGTTATCCCTATCCTCAGTCAGTGAACATATTTAGCTGAACCCTAAATCCCAAGGATTA
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ATGCGAAGGGTTATTATTATGAGCCTTCCCTGTTAATGAGTATTAATGAGCTAAGGCTGC
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TATCTTTATTCTTAGCTAATTGCTTTAGGATACCTGCCCCCATATTATTCTGCATTTTCA
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GTGACTTGAGATATTCCATGTAAAGTTCTTGCACAGAGCTTGGCACAAAAAAATGTAACA
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GAGTGATCTCTTAATCCAGTCCCATTATTTTATAATTGAGGAAACTGAGGCTCAGAGAGG
GGAAGTGACTTTTTGAAAACCACACATCCTTTATTAAGGAACCAGGTCTGGTTTCTGAGT
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GCTTCAGGCTACATTGTTTTCCAGAAAGAAATGAGACTTTGCCAAACTCTGGGGGAATTT
TTCAAGCTTTGAATATATCTTGTTTCCTTTTAAATGAGTCCTAGTTTGTAGACATATCAG
TGCCTGAACATAGACACCCACAGAATCACCCACAACTATGATTGAGGGGAGGAGGTGTCG
AGCAGACAGCATGGGTGCCTTGGGAGAGGGAAAGGGAGGTGGGAATGTGGGAAAATTGTG
CTCTGGGCTCCCTGAGAGGTGGTGTGAAGAGGGCAGCACTAACAGATAGGGAATAAGGCA
GGTTAGAGGCACTGGTGCTGGGCGCGCTGAGGGAAGGGGACCAGGGATGCCATGAAGGCC
AAGACCTAGGGGTTAGACCCAGCCAGGAGAAAAGAAAGGCTTTTTCTTGAAGAGCTCAAA
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AAAGCTCAAGCTCCATGGCACACTATCAGGGTACAGAATTTGCCAAGCACATTCTGCAAA
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ATTGATACTTTGCTAATTGCTCTTTTATTAAAACCATATTTCTGCATATTATCCATCTAA
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GGTGGTCCCTTTTGTGCAGCATGGAGACACACATTCACATGCAGGTGGCATGATGTAATG
AGAGGGTTAAAAGTACCAGCTCTAGAGTCAGAAAGACCTGCATTCAGCTTCTTTGAAACC
CCTTGCATTTGTAAATCACCAGCTCTCTAAGCCTGAGTTTTCTCATTGTAAAAATGGTAA
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ACAAGTAGCAAACACTCATCAAAGCTTTACTGTTGTTTTTATTATATATAAATACACTGA
GATTTCTGTGAGCTTGCCTGTCTCCCCCTTTAGACTTTGAGTTTCCTGAAGGGAAGGGAC
CATAGCTGACCTCTGCATCCATCTCCTAGCACAGCAAAGGACAACCCTGTAGCATTGTAG
CAAGGATTAGATGGGTGAGTACAAGGCACATGATTGAGCAGCGACCTGCATGGAGTACGT
ATGTGACAATTGTTGGCTCTTGTTGCTATGGTCTGCTAAGCCAATATGCATGGCCTTGAA
AAGTGGTGTCTAAAGTCCTGAGTATTGCTCCTTGGTGAACATCGGGGGAGCCCAGGGCCC
AGGGAGGGTCCATAGTAGCTGATAGAAGAGCCAAGGACTGGCTCTGGGGTCAGGAGAAAA
GGTTTTCCAGCCGGCTCCTTCCCCACCCTGCTGAGTAGCATTAGCAGAACCCAAAAGAGA
CCTATAATTTTAGGAGAGGGCCAAGTGGTAGGAGCTGTGGCCTTGGGTAGGGGAATGCAG
CCGTGGCTTACTCTGGTTTAGCAGGACTTAAGAAAATAAATGTCTTGGCTTTCCTCTACG
TCCACTCTTCTATCTCCTCCTTGTGTTTTTTATTGGCTAAGCCTAGCTGAAACCAGAGAG
CAAGAGAGGTTGGTGATAGAGCCATAGAAGTCATTCTCTTGGGATTCATAGGAGAGTAGG
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GCCTCCTCTCATGCAAGCAGATCTCCTTGATCTTCTAAACCAAGCCACAGAACCCTATCA
TATTTTGAACAATTTTTCAGTCCCAGTTCCTTGGGGCTTTAGCTTCCCTATCCATTTTAC
CCATCAGTGTCACACTCATACCAGCCAGCCCTTGGTGATGTGTCAATTTTCCATCTTCAC
CTGACTTTTCAAAACTCAAGTCCCTGGGGAGATCTCTATGTGTAGGCTCCACCTCTCTTC
CTGGAGCCACAAATGCTCAGAACTGGGGCTTTGAGAGCTGCCCTGAGTCGTCATCTCTGT
CACATCTGATGACAGTTTTTATTAGGACTTTCTGAAAGCTGCTTTCAGTTTCAGGATGTG
TGTCCAACCTTTTCTCAGCCATTAGGAACCCTGAGCTGATACAGTCACTTTCCCTCAAGG
CATCTGTCACTTACAGTTTGCCAACCAGTTCCTCCTTGCTGGTCATCATTAGGGCCGGAG
AAGCAGGTCCCACTGGGAGTTGAGGTAGTGAGGGAGAGAAGCCAAGAACTTTTTAGATTC
ATGTCTTTAGTCAAATGAGACTTGGAATAGCCATGTGGCAGGTTAAGCCTTCCATCACTT
TTAGAGTTGGTCAGTCCCAGGCCCCTAACTATGCCCCCTTGCAGTCCCTAAAGACCTGTC
TTAATTTCATCCCAGGGCCCAGTACCTACTCTCAGACTCTCTGGTAGCTATTGTGGCCTG
CTCCCTCATCTGCCCAAATGCAAGGAACTAGAAATAGTGCCTCATTGCAGCCCCTCGTCA
TTGTATGATCCCAACCTACTCCAAATACCCACCATCTATCTACCCAATTACCACTGTGCC
CTTCTCAATCTTCTTCAGATGAACTGATCCCTTGGGTGGTAGACAGAATAGTAATCACCT
TTCCCCTCAAAATGTTCATGACTGAATCCCCAGAATCTCTGAACATATCATCTTATATGG
CAAAAAAGACTTTGCAGATGTGATTAAATTAAGGTTCCTGAGATGCGAAGATTATCCTGG
ATTATCCATGTGGGAGTCAATGTAATGACAAGGGTCTTCATAAGAGGGAGGCAGGGGTCA
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CCATGAGCCAAGGAATGTGGGCATCCCTAGAAACTGGAAAAGGCAAGGAAAGTATTCTCC
CTGGAGCCTCCAGAAGGAGCAGAGCCCAGCTGACCCCTTTATTTTAGCCCAGTAAGACCT
GTTTTCAGCTTTCTGATTTATGCAACTGTAGGAGAATAAATTTATGTTATTTTAAGCCAT
TAAGCTTGTGGTAATTTGTTACAGCAGCAATAGGAAATGAATACAACCTGCTACTCAAGA
AGTGTGGTCTACAGCAGGGGTCCCCAACCCCTGGGCCATGGACCAATACCAGTCTGTGGC
CTGTTAGGAAGTAGGCCACACCAGCAGGAGGTGAGTGGCAGGCCAGCGAGCATTACTGCC
TGAGCTCTGCCTCCTGTCAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGAAGTGAGAACCCT
ATTGTGAACTGCTAAAGCGAGAGATCTAGGTTGTGCACTCCTTACAAGAATCTAATGCCT
GGCCGGGTACAGTGGCTCACACCTGTAATCTTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGA
TCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAGCACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAA
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TGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGAGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCATGCCA
CTGTACTCCAGCCTGGGCAAGAGAGCGAGACTCAGTCTCAAAACAAAACAACACCAAAAC
CAAAAAAAAAAAAAAGGATTTAATGCCTGATGATGTCACTGTTTCCCATCACTTCCAGAT
GGGACCAGCTAGTTTTAGGAAAACAAGCTCAGGGCTCCAACTGATTCTACTTTATGGTAA
GTTGTATGATTATTTCATTATATATTACAGTGTAATAAAAATAAAGTGCACACTAAATGT
AGTGCACTTGAATCATCCTGAAACCATCCCCCTGACTGTGGAAAAATTTTCACAAAACTG
GTCCTTGGTGCTAAAAAGGTTGGGGACGGCTGGTCTGTGGCATCACCATTACCTAGTAGC
TTCTTAGAAATGAAGAACCTTCATCCTCACCCTGGACCTGCTCACCCAGGATCTGTAGTT
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ACCCCTACCTGCAGATATTTAGCTCCAATTTGAACCAATTCAAATTAGAAAGGATCCAGT
CCAATGAAAGAAATAGATTTGTTATGAGAAGAAAAAATGACCACCCCCTCTACCTTTTTT
TTCCCTCACCTCACTTTTATCTAAGTATAGCTAATAAAGGACCAGATTTTTAAGAATTAT
TTTTAAAAATTTACTTATGTCTTTAATGCCTTATTATTTTTTCCTGGTGCTGAGGTTAGG
GTAGAAGTAAATTTTAGATTCTGAAGCTGTTACCATAAGCCAATCGTTGTCCTATCCCCA
TCACATTTGTTGGGGACTCCCTGCATTACTGGCCCTGAATAACCACTGAGTGAGAGGTAG
GGGTATTTCACAGGGGTGATAAAGTAGGATGTGTCTCAATGGTGGAAATTCGATTTGCAC
GCTGCTCAACCAGAATCAGCATAAACTCTGAGCCTTGCTCTGGCCATGACCTGGGTAGGT
AGATAGATCCAGATTTATCAATGGCTCTGAAACAAAGGGAAAACCCCACACACTATGGGA
GGCCAGCACTGACCACCAGATGAACAGGAAGCCTTGATGTATATGCTCTCATAATATATC
CTTCTGTGTGAAATACTACAAATTTCTCCCAAGACAAGAAGTTGTTACATTCATTTTTTG
GCAAGTACAAGAGGCAGTCATCCCACAAAGTCTAGGAAAGGGGATATATCTTTTGGATTG
CAACCCCTCAAATGGACTCCTCAAGTGATTTGGGGTACTCTTCCTGCTGCCCCATTAATG
GGGACATCTGGTTCTAGACCCAGCCCCTCCTAATTTGATTTCCATTTGCTGTTGAGCTTG
AAACTCCTATTCTGGAATTGCCAGAATATCCTGAATTCTTCACAAAAGTCTTCTTGAGGG
GGAAGCATTAATAGAGCTCCGTAGAGAGCCATGAGTCCTTCTCTCCCTAAGGTCTTGATA
CAAGAGAGTCTTGTTAACTGTCAGCCAGTATCACACTGGTTACCTCCTGGAGCCTCTGTG
GGAAAGAGCATCTCAATGCTTTGAGGGAGACTTTGGGTTGAAATAGGTTTCCAGGATAAT
TAACACCAATTGAGAACACAGGCAAAACTTCTTGTCTTCCAAATTTGAAGCCCACATTAG
CTAATTAGTTCTAATTAGAGGCTGACAGTTCCATGTGGCACAGTGAGCATGTAATAGGCA
GATGTTTTTGTATGTGTCTTGACAAATTAATGAAGATGGGTTGGGGGATTTCTTTACAGG
CCCATGGGCCAGCTAGGTGCTAGAACATATCTTTTCTTGGGAAAGGGTTTTGGTTTTGGG
GAAGCTTACGTGGTGCCCCCAGAGGAAGCCCATCTATTGATAATAATGCCTTTATGTATT
CCAGAAACACATAGTGAGCACCTACATTGGCGAAGAATTGGTCGAAGTAGTGAAGGAGAC
ACTACTTTCACTATGTGGAATCCCAAAGTCTAGTTGGGAGGCAAAAATAAACCGAAAGGA
TCCAGTGGCATCCTAGCCAAAGCAGTAAGATAAGAAAAATACAAAAGGAGATCTAAATAT
TAGGAAGATCCAAAATGCCACAGTTTGTATGATTCCATTTATATGACATCTTGGAAAAGG
CAAAATTATAGTAATGGAGGACAGATCAGGGCTTGCCGGGGTTTGGGGATGGGAAGAGGT
ATTGACTAAAAAAGGGCAGCACAAAGGAATTGTTTGGAATTGTTCTGCATCCTTATTGTG
GTGGTGGTTATACAAATCTGTGTATGTGTTGAAACTCGTAGAACCGTATGCCAGTTTTCC
TGCATGTTATTTTAAAAAATGAAAGAAGAAAAAATGGATTACAGCTTATGTATGGACCAA
CATCTATGCATCTCAGTGTCGAATAAAACCCACAAATTTATTTTACATTGTTTGAATTTT
CAGACAATTTTGAAAAGCATGTCTTTAAAAAGTAATCCTTAGCTCAGTTTGTATACATAC
GTATTTTTATAACATGAAGATCTTTTGCATTAATGCATAAACTAGTTGAAATAAACAAGG
AAAGAATTGTAAACTTTAACTCATATAAAAATAAATTAACATAAAAGTGTTAAATTTGGG
TTTATAGGAGATATGGAGAGAATCCTCATGGCATTTGAGACTCTAATTCTAGTTTTTCCT
GAGCCTTTGGGTTTAGTGAGGTGCCTCAATATCCTCATGATAAATTTACCATACTTGTTT
AGCCTAAAAAATACCATGATTTATAAGTGACATGTCTGTCTATATAAAAAATTCAAGAGA
CTCAGCTAAAAGTAGTTGATGCTAATAGGAGTGTTCAGTAAGGTAGTGGGATGTAAGATG
AACATGAAGAAAAATAGCATTTCCATTGATTAGAAATATGTAATTAGAAAATACATATAA
AAGGATCCCATTTATAATAGCAGCAATAAAAACAATATAAAACTCTGGGTAATTAACTAA
AAATAGTCCAGATTTATATGAAAGCAAATACAATACTTTACTGAAAGCCATGAAGAATGG
CTGGAATCAATGAAGAGACATATCATGGTCCTGGATTGGAAGAGTCAATCAAAAGTGTAA
AGATGTCAGTCCTTCCCAAACTTATGAGTAAGCTCAAAGCAATCTCAGTGAAAATTTGCG
TGAGCAAAAGCATAGGGGACGTGAAAGCTGATTCCTCAGAACGTAAGCAATCTAGGCGGA
CTGACTGAAGCATTGGTGGTGAGAGTATGAGGTGTTCTCCTGGGACCAGACTATGAAGAG
CCTAGGCTGCTAGACTGAGGACCATGCCCTTCATCTGACAGCCCATAAGAAACTCTCGAA
GATTTCAGTTCAGGAACTAATAAGATCAGAACTGTGTGTGAGAAATAGATCTTGGCTGAT
GTGTAGGATTGAAGGAAAGGGTGAGACCCAAGGCAGGGACCCTGACCAGGAGGCTGCTAA
CTGGAATGGTCTGAAATGACTGCCATGCTGCCTGATCCAAAGGAGTTTCCCAGTGAATAT
TAGCACTCTCCCCTCCCCTACACCCCACTCCCCTGATCTTCCTTTCTCTCCCCTTCCCTC
CTCCTCTGAAGCAAAAACCCAGTGGAGAAATGAACTAACAGAGTTGCCCTGAGAGGGGGT
GAGATATTTTCTGCCAATCTGGGGTCATTGGGGAGGGTTATCTTAAGGAAGATGCCAAGG
TTTGGAATCTGGAAGCCTGGGTGGACAATGATGATGATAAATGCTACTTTAAATATTTAT
TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAAGACAGAGTCTCACTCTGTTACCCA
GGCTGGAGTGCAATGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTTCTGAGTTCAAGTG
ATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGGCACACACCACCACACCAGGC
TAGTTTTTTTTTTAATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTTTT
GAACTTCTGATCTCAACTGATCCACTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTGCAGGC
GTGAGCCACCGCGCCCAGCCTAAATGCTACTTTTTATTGAGCATCCACTATCCGTAAGAC
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TTTATTTATTTATTTATTTTTTAAAGAGGAAACAAAGAAGTTAAGTGTTCAGAAAGCTGA
GGCAGGACCTAACCTGGTCACTGGTCATATCACCGACATCCCAGCACCGGGTACAAAGAG
TTCAGCAAATGTTTGCTGTTCACCAGATGTTGCTTCTCTAGAAATGTCCTTGCTGTGGGT
TTGGCTGATGCCTTATCTTTATGAGTAAATCCCTTTTCCTTTCATAAATAAGTCACCATT
TTGCAAGGAGGGGAAGAGAAGCGTTGAACAGGAAGGGTGGGGAGGTAGGAGCAGAAAAGA
AGGGGCTGAGTAATGGAACTCGAGGTGTTTTTATAAATTAGGAACCACCCAGCTTGCCAC
TGACCCAGGCATCTTTATCAATTTGCTCCTCCAGGCCATGCCAGCCTAGCACAATAAAGC
TTCCTGTCCATTTCAGGCTTAATCACACAGAATGTAAATCCCTCAGCAGAGAGGCAGCTG
CGAGGGATGGGGCACAATCCGCAGGGCTGTTCATTTTCATCTTCTGGCACGTAATGAAAT
CAGGAATGCATGTCTGCTCACCAGGGCTTCTTTGCTCCAAATTGTTAAGTAAGCATCCCT
GCTTTAGCCTCATTAGACTCCCAAGGCCGCTGATGAAGGGGGATGGAAGCCAGCATTTAT
TGAATGATTCTGGTGTGCTAGATACTTTCTACGTGATTCACTCCTCTAAAAAGCCCCGTG
ACATGGGCACTATTATCCTTATTTTACAGCTAAGGAAACTGAGCTCAGAAAGGTCAGCCC
AAGATCATGGACGGATAAAATGAGTAGGGAATCATGAAGCGACATATCTGTGCAATTTCA
AATCCTATACCCCAAGCCTTTTTTTTTTTTTTTGCAGTTATTAGATATAAAATAACTTTT
ATATAATTTTGGGGGGATTTCTGGGAGAAGTTTGAGGGAACTGAAGGTTATTACTTTTCA
TAATTCATTTTGGTTGTGTCAATTTAATTAACATTCACTGAGACTCTGATCCACTGTGGC
TCTGATTTTTAGGCATAACTTGTGTGTCCATCATTCATGCTAAATAGAGATAGTAGTCCT
GTCCTCTGCTTCTGCTCCTTTTTCTTCTTCTTAGTTTTTAGACATCCTGGTTTGTGTTCT
AGTTCATAATATCTGCCCTAAGATCTTCATTCTTATTTTGAAAACTACATTTAGTTCCTC
TTCTAATACCCCTTGTCCTGCCTCATCCGATTCTTATTTTGCCCCTTGTACTATTCAGGG
ACACCTGCGGCTCCAGGTCAGAGATGCACCTGCTAGTCCTGCCTCTACAGGACCCAACCC
ATCAGTTCCTAGCTTGTCCTTCTGGTGAGAATTGAGCACACTATACTGTGGACATAAAGA
CAAGTAAGTTGTCATTCATGCCCTGGATGAACATGGAACCTAACTGGGAGGTAAATACAC
ACCTGAATAATTAAAAAATAAGCTATAATTGAACAAATGCTAGAGTAAAGTGCATACAGA
AATTTTAGGAAGTTGGTGGGTAGGGGAGTAAATAATAATGTGTTGTTCCTTAAGTCATAA
TAAATTTCAAAATATCTGTTAACATCTATTTCCTCTATTCCCATTACTATGTGAATTCTT
AGTTCCTGACAAATGAATTAGTTGAAACAGTAACATTATTTTGGTATTTTTATTTATTGT
TTATTCAGTCTGGGTCAACATCATAGAATGCTGAATCAGCAGGCAATTCCACAATAATCT
GCTTGAGTACAAGAATTTGAATATGATATGTTGTAGGGATAGCAGGATACCAATATGGGG
AGTGGGTTTGGGTAGCCCCCCATACCCTTAAGTGAATAAAGGGCTAGGCTGGAAAGTTAT
GAATGTGGAATGGATGGTTTGAGAACTCCAGACGTGGGGCAGGTCAACACTGACCTCTTA
GGAGGAAGGAGTTTAGATGGGATAACATTTTGACATTCCCTTTGGACAGGGACCCTATGG
ATTAAGTGGGAAAGCTAGAGAGGGAGAAGGAAGTGGTTGTTCAGATAACATAGGTGGGAC
TTCCAGATTCAGGTGGCATCTGGCTGTGGCACTTGGGTTCCCTTTTCTCCTCACCCGTGG
CACTTCTCATGAAGACACAGAAACCACTACTACTTTTTGGTAACATGGATTCTGGGCCTT
GGGTGGAGTTTTTACTTAGTAAAGCAAGGATGATACTCTTGGGCAAAAGAACAGAAAAAT
ACATGATAGGAGATTTTCAGTTATTACTCCTATCTACTTCCTGCCTTAAAGGCAGTGTCT
CCACTGAACAAAAGGAGAGAAACCCGCACTTACTACACAGAAGCTGTTTCTGAGGCCATT
TAACCTCCAGCACTCCCTATTATCACTTCTATTGATTTACCATTTGTGGGACTAATTTAA
ACTTTCTAGAAATTAAAAAAGCAGGAAGGGATCGTGGCAGATGAAAACAGGATATGGATC
TTTGCATATGTGTCTTAGTCTGTTTGTGCTGCTAAAACAAAATGCCATAGACTAGGTAAT
TTATAAGGAAGATAAATGGATTTTTTCATGGTTCTGAGGATCTGGAAGTCTAATATCAAG
GCGCTAACATCTGGTGTCTGGTGACGGCTGCTCTCTGCTTCCAGGATGGCTCCTTCTTGC
TGCATCTTCCAGATGGGATGGACACTGTGTCCTCTCATGGCAGAAGAGTGGAAGAGAAAA
CACCCACTCCCTCAAGCCCTTTTAAAATGCCGTAATCCCATGCATGAAGGTTTTGCTTTC
ATGACTTAATCACCTTTTAAAGGCCCCACCTGTTAACACTATCATTTGGGTGATTAAGTT
TCAACATATGAATTTTGGGGTGCACATTCAGGCCATACCAATACCAGACTGTGAAATCAA
CGAAATTGACTGTGAAATCTATGAAAGAGTAGAGCTAGAGAGACCTGTGAGACAGTTATA
TGCTGGTGAATGTAAATGTCCATGCATTGCTTTTCCTAAAGCAGAGACGGCTGCATACAA
TTATCCCAGAATATTCCCTCCACATGTTCCGAAGTCAGCCCATTCTGGTCTAGAATACAC
ATGAGAATAAGGACTGTACCACTAGGAATTTGGAATCTGTGCATATTAATCAGCCCTCAG
CTTAAGGTCTAGATGTGGATTCTAATTATAGTCATGTAGTTAATAACAAGGACCAAAGAA
GATCCATCCAAACTATGTACTGGCAACATGCCTGACCAGCTTTCTCCTTTATCAAGCATG
AATAATAGGAAAAACAAAACAAGAGACCTTGAAGATTTTTCTGAGACATAAAAAGGAGAA
TACTAGATTCAGAAGAAAAATGTCTTGAAAAAATATAAAATAGTTAATAAAGGCATTTAC
TAGGATGCGTCTTTTTGTGTTCTCAGTAAATTTGAACGCTGAGATACAAGAAACGACAGA
TGACATAGTAAGATTAAAAGAGTTGCTAAGATGCAAGCAGAAATTGAGATAAAGATTGTA
AATACCTGTAAAATCCAATAGCTTAATAAAACTTGTATTGGGATTAGAAGCAGTAAAGAA
AATAAATAATATTGCAGAAAATGGAGTTGGTGTTAAGGAAGATGCAGTTAAGAAGATCTC
CTGGAATGTAGAGAAAAAGCCCAGGGAAAGAAGGTAGTTATCAATGGGGAGGATATATGG
AGGACAGAGAATGGAAATTCTGGGCTGTAGGGACAAAAGATGGAAGCAGTGTCACTGCGC
CCAGGGGCAGGGATCACCAAGTAGAAACTGGAAAAAGAGGGAGCCTTGTCCAGCCCAAGT
TGGAGTCACAGAAGGGATGCAGTCAAGGCAAGGAAGAGGGGGAAATACCCTTCTTCTTGC
TTTCCACACTGCAATCTTCTGCCAGTCTGTATCTCTGGCCAAACCTATCCTGAAGGGAGC
GGATGAGGGAACCTGGAAAATGCAGCCTGTATGGGTCAGCCCTACTGTGATACCAAATAA
GCAACGGAAAGGGCAGGGATGGGCATGAGGGCAAAAACAGGTGAAGGACTGGTCTATACA
ACTTAGAAGACACTTTTTACAACAAAAACTGCCTGAGTCAAAAGTTGATTTGACTGACAC
AAATTAAATGTATCAGTTAAATACGTGAAGGCCAAACATGACAGTAAATGGATTAAATTC
CTCCATTAAAAGAAGATCTGTCTTAGATTTGGTTTAGAATCCACCAAAGCCAATTATAGC
TATTTGTCAAAGCTTCACCTAAAAGAGGCAAAAAAAAAAAAATGCTAAAAATAAAAACTG
AGACTAGGAGTGACAATATTAACATCAGTAAAAAAGTATAGTACAAGGTAAATATAATTA
TTAGAAGTCATTTTATGCCAATGAAAGAAAATTCACATGAATGCTATGATCCTAATTTCC
ATTTATCTCAGTGATTCTCAACTAAGTTGGTAAAAGATGCCCCAAAGATCATATCAGAGT
CTAAGAAGTCATTTTATAAAAACTCACATACACACATATTCTGATATTCAGCGGGAGGGG
GCAAGTAATCCCATTTCCACTGACCCAGAATTACTACTGATGGGCATACATTGCAGCCTT
CAGATGTTGTGGCAAACAACCAACCAACCAACCAAAAAAACCCTAAACAAACCCAAAACA
AAACAAAACAAAAAACCAAAAAACCATCATGTAGCCTTTGGTTTAAAATAAATGTATGAT
TAGTAATATTGACTTTGATTTAATAGATTTGGATTAAATTTTGTGTTCTGAAAATGGCAA
GAAAATTTTCATTGTTTTTATGCAATAAAACATGGAACATTTATCACAATCTATACTAGT
TTATAAAGAAAATTGATGATCAAGATATTGGAAATGATTCTGGATAAAATCTCTGATAAG
AATGAAATAAAATTAAAATTAGTTTAATTTTATAAAGTGTCAATGAAAAATTCCAAACAT
CAGTTGGCTGTTAACATGTGGCTTTATTTCTGGATTTTCTATGCTGTCCCATTGGTTTAT
GTGTCCAGCTTTATACCAATACCATGCTGTTTTGGTTATTATAATTACGTTTTTGAATGC
TGTTGGATTTGATTGGCTAATGTTCTGTTGAGGATTTTTGCATCTCTGTGCATTAGGGAT
ACTGGCCTGTAGTTTTTCTCTTTTACATGTGTGTCCTTATCTGGTTTTACTATGAGGGTA
ATGCTGGCCTTGTAGAATGAATTAGGGAGAATTCTCTCCTCTTAGATTTTTGGGAGTAAT
TTCAGAAGGATTGGTATTAGCTTATCTTTGTAAGTTTTGTAGAATTCAGCTGTGAATGCA
TCTGGTCCTGGGCTTTTCTCTGTTGGGAGAGTTTTTATTACTGATTCAAACTCACTACTC
ATTTTTGGCCAATTTAAGTTTTCTATTTCTTCCTGATTCAATCTTGGTTGGTTGTGTGTT
TCCAGGAATTTATCCATTTCCTCTAGGTTTTTCAGTTTGTTAGCATATAGTTGTTCATAA
TCATCTTTTGTTTTTCTGTAGCATCAGTTGTAATGTCTCCTTTTTCATTTCTGATTTTGT
TGATTTAAGTCTTCCCTTTTCTTGTTTAGTCTGGCTAGTGGTTTATTGACTTTGTTTATC
TTTTCAAAGAATTGACTTTTTTCTTTTATTGACTTTTGTATTTTTTTAGTCTCTATTTCA
TTTAGTTCATTCTAATCTTTACTATTTTTCTGCTAATTTGGGGTTTTGTTGTTTTTTCCT
TTTTTAGTTTCTTTAGGTACATTGTTAGACTGTTAATTTATAATATTTCCACATTTTGAT
GTAGGCATTTATTGATATAAACTTCCCTCTTAGCACTGCTTTTGCTATATCCCACAGGTT
TTGGTTGTTGTATTCCCATTTTAATTTGTTTCAAGAAATTTTTTTATTTTCATCTTAATT
TCTTTGTTGATGTAATAGTCATTCAGGAGCATTTTTTAAATGAATTTGTATAGTTTCCAG
AGTTCCTCCTGGTATTGATTTATTTGTTTTATTCTATTGTGGTCTAAGAAGATACTTAAT
ATAATTTTGATTTTTAAAATTTGTTGAGACTTGCTTTGTAGCTTAACATATGGTCTATCC
TGGAGAATATTCTATGTGCTGATGAAAAAATGCATATTCTGTGGTTGTATAGAACGATCT
GTAAATGTTAGGCCCATTTGGCCTAAAGTCCAGTTTAAATCCAATGTTCTTTGTTGATTT
TATGTCTAGGTGACCTGCTCAATGCTGAGAGTGGAATGTTGAAGTTCCCCACCACTACTG
CATTGCATCTATCTCTCTCTTTGGACCTAGTAATATTTGCTTTATGAATCTGGATGCTCT
AGTATTGAGTGCATATATATTTAGAATTGTTAGATCCTCTTGCTGGGTTGATCTTTTTAT
CTTTATGTAATAATGTTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTTT
TTTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTACTGTTTTTGAGTTGAAGTCTGTTTTA
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86409 (+) S01424 TGANTMA
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100721 (-) S00326 GGGGCGGGGG
100722 (-) S00857 GGGGGCGG
100634 (+) S01193 GGGNGGRR
100720 (-) S01193 GGGNGGRR
100634 (+) S02016 GGGTGGG
100586 (-) S00742 GGTCC
100547 (+) S02023 MAMAG
100577 (+) S02023 MAMAG
100670 (+) S02023 MAMAG
100729 (-) S02023 MAMAG
100647 (-) S02023 MAMAG
100486 (-) S02023 MAMAG
100715 (+) S01964 SCGSSSC
100741 (-) S01398 TCTCTTA
100619 (+) S02137 TGGCA
100660 (-) S02137 TGGCA
100466 (+) S01375 TGGGC
100654 (-) S00864 TGTCCT
100508 (+) S02000 TKNNGNAAK
100561 (+) S01974 TRTTTGY
100573 (-) S02121 WCTGG
100573 (-) S00487 WCTRG
100537 (-) S01773 XGGAYGT
100711 (+) S00346 YCSCCMNSSS
100713 (+) S01081 YYCCGCCC
for promoter at position - 1776
1578 (-) S01153 AARKGA
1577 (-) S01090 AATGA
1672 (+) S00099 AGCCACT
1521 (-) S01946 ANATGG
1574 (+) S00089 CANYYY
1708 (+) S00089 CANYYY
1700 (-) S00089 CANYYY
1666 (-) S00089 CANYYY
1555 (-) S00089 CANYYY
1501 (-) S00089 CANYYY
1487 (-) S00089 CANYYY
1559 (+) S01616 CATTW
1574 (+) S01616 CATTW
1642 (+) S01616 CATTW
1555 (-) S01616 CATTW
1746 (-) S02113 CCAGCTG
1697 (-) S01187 CCCCGCCC
1696 (-) S00801 CCCGCC
1697 (-) S01936 CCCMNSSS
1695 (-) S00802 CCGCCC
1636 (-) S00040 CCTGC
1505 (+) S01622 CWKKANNY
1774 (+) S01622 CWKKANNY
1525 (-) S01622 CWKKANNY
1574 (-) S01590 GATAAG
1544 (-) S01089 GCCAA
1691 (+) S00781 GGCGGG
1690 (+) S00978 GGGCGG
1689 (+) S00974 GGGGC
1723 (+) S00974 GGGGC
1689 (+) S00979 GGGGCGGG
1690 (+) S01193 GGGNGGRR
1532 (+) S02023 MAMAG
1618 (+) S02023 MAMAG
1706 (+) S02023 MAMAG
1731 (-) S02023 MAMAG
1668 (-) S02023 MAMAG
1569 (+) S00477 MYWATCWY
1739 (+) S01950 RCAGNTG
1477 (-) S01950 RCAGNTG
1695 (-) S01964 SCGSSSC
1513 (-) S00484 TATCTC
1478 (-) S01056 TGCAGGTGT
1541 (+) S02137 TGGCA
1565 (+) S00864 TGTCCT
1766 (+) S02121 WCTGG
1658 (+) S00487 WCTRG
1735 (+) S00487 WCTRG
1766 (+) S00487 WCTRG
1663 (-) S00487 WCTRG
1575 (-) S00381 WGATAR
1641 (-) S01629 WGNAMCYK
1695 (+) S01773 XGGAYGT
1697 (-) S01081 YYCCGCCC
for promoter at position - 80365
80074 (+) S01153 AARKGA
80208 (+) S01153 AARKGA
80247 (+) S01090 AATGA
80254 (+) S00744 AGAAATG
80099 (+) S00922 AGAGG
80166 (-) S00922 AGAGG
80256 (+) S01946 ANATGG
80328 (-) S01946 ANATGG
80122 (-) S01946 ANATGG
80172 (-) S00109 ATGCAAAG
80121 (+) S00880 ATTGG
80360 (+) S00880 ATTGG
80324 (+) S00089 CANYYY
80313 (-) S00089 CANYYY
80260 (-) S00089 CANYYY
80229 (-) S00089 CANYYY
80220 (-) S00089 CANYYY
80199 (-) S00089 CANYYY
80180 (-) S00089 CANYYY
80151 (-) S00089 CANYYY
80091 (-) S00089 CANYYY
80324 (+) S01616 CATTW
80260 (-) S01616 CATTW
80199 (-) S01616 CATTW
80364 (-) S00633 CCAAT
80125 (-) S00633 CCAAT
80267 (+) S00040 CCTGC
80159 (-) S00040 CCTGC
80233 (-) S00996 CTTGCAT
80165 (+) S00994 CTTTGCAT
80076 (-) S01622 CWKKANNY
80165 (-) S00973 GAGGC
80165 (-) S02135 GAGGCC
80189 (-) S01909 GAGGTC
80359 (+) S00780 GATTGG
80158 (+) S00974 GGGGC
80187 (-) S00742 GGTCC
80153 (-) S01544 GSSWGSCC
80213 (+) S02023 MAMAG
80340 (+) S02023 MAMAG
80169 (-) S02023 MAMAG
80110 (-) S02023 MAMAG
80364 (-) S00477 MYWATCWY
80133 (+) S02095 RRRCWWGYYY
80142 (-) S02095 RRRCWWGYYY
80208 (-) S00972 TAGGC
80335 (+) S00087 TATAAA
80335 (+) S00615 TATAAAA
80335 (+) S01540 TATAWAW
80266 (-) S00484 TATCTC
80084 (-) S00483 TATCTT
80297 (+) S01424 TGANTMA
80303 (-) S01424 TGANTMA
80325 (-) S02137 TGGCA
80273 (-) S02137 TGGCA
80154 (-) S02137 TGGCA
80142 (+) S00044 TGGNNNNNNGCCA
80198 (+) S01037 TGTTCT
80140 (+) S02121 WCTGG
80140 (+) S00487 WCTRG
80080 (+) S00381 WGATAR
80362 (+) S01773 XGGAYGT
80142 (+) S01994 YGGMNNNNNGCCA
for promoter at position - 56123
56103 (+) S01152 AAGTGA
56103 (+) S01153 AARKGA
55957 (-) S01153 AARKGA
56039 (-) S00192 AATAAAT
55956 (-) S01090 AATGA
55949 (-) S01090 AATGA
55980 (-) S00922 AGAGG
55889 (+) S00392 AGGAAG
55911 (+) S01946 ANATGG
55901 (-) S01946 ANATGG
55948 (-) S00833 ATGAAAAT
56054 (-) S01029 ATGCAAAT
56054 (-) S00033 ATGCAAATNA
56047 (+) S00814 ATTTGCAT
55994 (+) S01904 CACCTG
55870 (+) S00089 CANYYY
55881 (+) S00089 CANYYY
55953 (+) S00089 CANYYY
56012 (+) S00089 CANYYY
56107 (-) S00089 CANYYY
56087 (-) S00089 CANYYY
55859 (+) S01616 CATTW
55953 (+) S01616 CATTW
55868 (+) S01003 CCCAG
55910 (-) S01003 CCCAG
55859 (+) S01622 CWKKANNY
55888 (+) S01622 CWKKANNY
56018 (+) S01622 CWKKANNY
56087 (+) S01909 GAGGTC
55979 (-) S01909 GAGGTC
56059 (+) S01089 GCCAA
55900 (+) S00436 GTCCGT
55923 (+) S01682 KGCWARGKYCAY
56073 (-) S00477 MYWATCWY
55832 (-) S00477 MYWATCWY
56001 (-) S01190 RYYWSGTG
55888 (+) S02024 SAGGAAGY
56092 (+) S01205 SWATWWAG
56037 (-) S00191 TAAATTA
55830 (+) S00972 TAGGC
56093 (+) S00087 TATAAA
56071 (+) S01540 TATAWAW
56076 (-) S01540 TATAWAW
55980 (+) S00124 TCAGGTA
55980 (+) S01999 TCAGRTA
55844 (-) S00152 TGGGAATT
55898 (-) S01375 TGGGC
56084 (-) S02000 TKNNGNAAK
56084 (-) S00121 TKNNGYAAK
56045 (+) S01150 TNATTTGCAT
55905 (+) S02121 WCTGG
55873 (-) S02121 WCTGG
55853 (-) S02121 WCTGG
55905 (+) S00487 WCTRG
55966 (-) S00487 WCTRG
55873 (-) S00487 WCTRG
55853 (-) S00487 WCTRG
56019 (+) S01773 XGGAYGT
for promoter at position - 59050
58771 (-) S01152 AAGTGA
58845 (-) S01153 AARKGA
58771 (-) S01153 AARKGA
58811 (+) S01069 ACCNNNNNNGGT
58822 (-) S01069 ACCNNNNNNGGT
59044 (+) S00922 AGAGG
58963 (-) S01904 CACCTG
58767 (+) S00089 CANYYY
58810 (+) S00089 CANYYY
58884 (+) S00089 CANYYY
58894 (+) S00089 CANYYY
58997 (+) S00089 CANYYY
58933 (-) S00089 CANYYY
58752 (+) S01616 CATTW
58786 (+) S01616 CATTW
59013 (+) S01616 CATTW
58974 (-) S01616 CATTW
59004 (-) S01051 CCAAGT
58807 (+) S00070 CCACACCC
58992 (+) S01003 CCCAG
58989 (+) S00802 CCGCCC
58828 (+) S01197 CTATTC
58769 (+) S01622 CWKKANNY
58786 (+) S01622 CWKKANNY
58916 (+) S01622 CWKKANNY
58982 (+) S01622 CWKKANNY
59013 (+) S01622 CWKKANNY
58762 (+) S00856 GCACTC
58934 (-) S00856 GCACTC
58994 (-) S00978 GGGCGG
58814 (-) S00555 GGGTGTGG
58956 (-) S02023 MAMAG
58939 (-) S02023 MAMAG
58891 (-) S02023 MAMAG
58957 (+) S01950 RCAGNTG
58967 (+) S00087 TATAAA
59021 (+) S00087 TATAAA
59024 (-) S00087 TATAAA
59024 (-) S00615 TATAAAA
58967 (+) S01540 TATAWAW
59021 (+) S01540 TATAWAW
59024 (-) S01540 TATAWAW
58801 (+) S00485 TCATCAC
58832 (+) S00262 TCNTACTC
58832 (+) S00264 TCTTACTC
58947 (-) S02137 TGGCA
58778 (-) S02137 TGGCA
58995 (-) S01375 TGGGC
58885 (-) S01375 TGGGC
58905 (-) S02000 TKNNGNAAK
58905 (-) S00121 TKNNGYAAK
58780 (-) S02121 WCTGG
58780 (-) S00487 WCTRG
58995 (+) S01629 WGNAMCYK
59020 (+) S01989 YTAWAAATAR
for promoter at position - 89636
89610 (+) S01153 AARKGA
89497 (-) S01153 AARKGA
89496 (-) S01090 AATGA
89343 (+) S00744 AGAAATG
89520 (+) S00922 AGAGG
89411 (+) S00099 AGCCACT
89345 (+) S01946 ANATGG
89576 (-) S01946 ANATGG
89387 (-) S01946 ANATGG
89443 (-) S00109 ATGCAAAG
89363 (-) S00880 ATTGG
89473 (+) S00908 CAACCAC
89396 (+) S01904 CACCTG
89565 (-) S01904 CACCTG
89360 (+) S00089 CANYYY
89414 (+) S00089 CANYYY
89441 (+) S00089 CANYYY
89493 (+) S00089 CANYYY
89498 (+) S00089 CANYYY
89580 (+) S00089 CANYYY
89635 (+) S00089 CANYYY
89630 (-) S00089 CANYYY
89625 (-) S00089 CANYYY
89620 (-) S00089 CANYYY
89410 (-) S00089 CANYYY
89349 (-) S00089 CANYYY
89493 (+) S01616 CATTW
89349 (-) S01616 CATTW
89359 (+) S00633 CCAAT
89403 (-) S01003 CCCAG
89407 (-) S00801 CCCGCC
89627 (-) S01936 CCCMNSSS
89406 (-) S00802 CCGCCC
89395 (-) S00040 CCTGC
89479 (+) S00252 CTGATTA
89521 (-) S00252 CTGATTA
89582 (-) S01971 CTGGRAA
89618 (-) S00794 CTTTCC
89436 (+) S00994 CTTTGCAT
89416 (+) S01622 CWKKANNY
89460 (+) S01622 CWKKANNY
89582 (-) S01622 CWKKANNY
89380 (-) S01622 CWKKANNY
89521 (+) S01502 GAGGAA
89533 (-) S01502 GAGGAA
89429 (+) S00973 GAGGC
89556 (-) S01089 GCCAA
89554 (+) S00437 GGCCG
89402 (+) S00781 GGCGGG
89401 (+) S00978 GGGCGG
89401 (+) S01193 GGGNGGRR
89535 (-) S01193 GGGNGGRR
89567 (+) S00742 GGTCC
89400 (+) S00064 KGGGCGGRRY
89400 (+) S01542 KRGGCGKRRY
89587 (-) S02023 MAMAG
89448 (-) S02023 MAMAG
89440 (-) S02023 MAMAG
89558 (+) S01190 RYYWSGTG
89601 (-) S00435 TACAAA
89448 (+) S00972 TAGGC
89343 (-) S00484 TATCTC
89419 (+) S00483 TATCTT
89462 (+) S01424 TGANTMA
89468 (-) S01424 TGANTMA
89462 (+) S01433 TGATTCAG
89400 (+) S01375 TGGGC
89594 (+) S01974 TRTTTGY
89607 (+) S01052 TTTAAA
89612 (-) S01052 TTTAAA
89385 (+) S02121 WCTGG
89385 (+) S00487 WCTRG
89339 (+) S00381 WGATAR
89423 (-) S00381 WGATAR
89408 (-) S01081 YYCCGCCC
for promoter at position - 73885
73594 (-) S01153 AARKGA
73604 (-) S00922 AGAGG
73715 (-) S00696 AGCCAAT
73709 (+) S00880 ATTGG
73839 (-) S00880 ATTGG
73866 (+) S00395 CACGCW
73670 (+) S00089 CANYYY
73789 (+) S00089 CANYYY
73804 (+) S00089 CANYYY
73649 (-) S00089 CANYYY
73628 (-) S00089 CANYYY
73841 (+) S01616 CATTW
73835 (+) S00633 CCAAT
73713 (-) S00633 CCAAT
73879 (-) S00070 CCACACCC
73673 (+) S01003 CCCAG
73874 (-) S01003 CCCAG
73638 (+) S00057 CCTGAWWA
73786 (+) S00489 CGTCA
73596 (+) S00794 CTTTCC
73626 (-) S01622 CWKKANNY
73603 (-) S01502 GAGGAA
73649 (+) S00973 GAGGC
73649 (+) S02135 GAGGCC
73714 (-) S01089 GCCAA
73880 (-) S00363 GCCACACCC
73872 (+) S00555 GGGTGTGG
73607 (+) S02023 MAMAG
73642 (+) S02023 MAMAG
73729 (+) S02023 MAMAG
73832 (-) S02023 MAMAG
73779 (-) S02023 MAMAG
73759 (-) S02023 MAMAG
73722 (-) S02023 MAMAG
73619 (+) S01205 SWATWWAG
73821 (-) S01205 SWATWWAG
73694 (+) S00191 TAAATTA
73812 (-) S00435 TACAAA
73751 (+) S00972 TAGGC
73851 (+) S00087 TATAAA
73854 (-) S00087 TATAAA
73851 (+) S00615 TATAAAA
73851 (+) S01540 TATAWAW
73854 (-) S01540 TATAWAW
73790 (-) S00665 TGACGCA
73863 (+) S02137 TGGCA
73799 (-) S02137 TGGCA
73676 (-) S00043 TGGGMNNNNNGCCA
73837 (-) S00044 TGGNNNNNNGCCA
73776 (+) S02000 TKNNGNAAK
73776 (+) S00121 TKNNGYAAK
73738 (-) S02121 WCTGG
73738 (-) S00487 WCTRG
73736 (+) S00381 WGATAR
73809 (+) S01629 WGNAMCYK
73885 (+) S01896 YAACKG
73837 (-) S01994 YGGMNNNNNGCCA
73855 (-) S01989 YTAWAAATAR
for promoter at position - 26283
26118 (-) S00234 AAAGTCCAG
26033 (+) S00816 AAGATGGC
26264 (+) S01153 AARKGA
26143 (-) S01090 AATGA
26069 (-) S01090 AATGA
26201 (-) S01013 ACAGCTG
26161 (+) S00922 AGAGG
25992 (-) S00922 AGAGG
26096 (-) S00392 AGGAAG
26133 (+) S01432 AGTCAGTCA
26034 (+) S01946 ANATGG
26061 (+) S00089 CANYYY
26066 (+) S00089 CANYYY
26180 (+) S00089 CANYYY
26248 (+) S00089 CANYYY
26240 (-) S00089 CANYYY
26112 (-) S00089 CANYYY
26038 (-) S00089 CANYYY
26022 (-) S00089 CANYYY
26001 (-) S00089 CANYYY
26206 (+) S01616 CATTW
26234 (-) S02113 CCAGCTG
26276 (-) S01003 CCCAG
26235 (-) S01003 CCCAG
26242 (-) S01936 CCCMNSSS
26280 (-) S00040 CCTGC
26109 (-) S00040 CCTGC
26049 (-) S01703 CMGTTR
26124 (+) S00318 CTCTCTGG
26075 (-) S00150 CTGTGGAATG
26027 (-) S00794 CTTTCC
26073 (+) S01622 CWKKANNY
26110 (+) S01622 CWKKANNY
26216 (+) S01622 CWKKANNY
26102 (+) S00973 GAGGC
26162 (+) S00973 GAGGC
26130 (+) S00207 GGCAGTCAG
26158 (-) S01498 GGGRNTYYC
26155 (-) S00742 GGTCC
26079 (-) S00742 GGTCC
26020 (+) S00839 GTGGAAA
26020 (+) S01543 GTGGWWWG
26073 (-) S01543 GTGGWWWG
26031 (+) S02023 MAMAG
26071 (+) S02023 MAMAG
26158 (+) S02023 MAMAG
26223 (+) S02023 MAMAG
26263 (+) S02023 MAMAG
26202 (-) S02023 MAMAG
26119 (-) S02023 MAMAG
26194 (+) S01950 RCAGNTG
26227 (+) S01950 RCAGNTG
26201 (-) S01950 RCAGNTG
26253 (+) S00087 TATAAA
26260 (+) S00087 TATAAA
26122 (-) S00087 TATAAA
26253 (+) S00615 TATAAAA
26260 (+) S00615 TATAAAA
26122 (-) S00615 TATAAAA
26253 (+) S01540 TATAWAW
26260 (+) S01540 TATAWAW
26122 (-) S01540 TATAWAW
26218 (+) S01426 TGACTCA
26218 (+) S01424 TGANTMA
26224 (-) S01424 TGANTMA
26218 (+) S01935 TGASTMA
26224 (-) S01935 TGASTMA
26021 (+) S00988 TGGAAAG
26129 (+) S02137 TGGCA
26273 (+) S01375 TGGGC
26048 (+) S00250 TGRMCC
26074 (-) S01937 TGTGGWWW
26224 (-) S01595 TKAGTCA
26127 (+) S02121 WCTGG
26271 (+) S02121 WCTGG
26251 (-) S02121 WCTGG
26127 (+) S00487 WCTRG
26271 (+) S00487 WCTRG
26283 (+) S00487 WCTRG
26251 (-) S00487 WCTRG
26074 (+) S01629 WGNAMCYK
26044 (+) S01896 YAACKG
for promoter at position - 53529
53427 (-) S01153 AARKGA
53306 (-) S01153 AARKGA
53459 (+) S01090 AATGA
53471 (-) S01090 AATGA
53305 (-) S01090 AATGA
53308 (-) S00744 AGAAATG
53248 (-) S01946 ANATGG
53302 (+) S00089 CANYYY
53387 (+) S00089 CANYYY
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53440 (-) S00089 CANYYY
53271 (-) S00089 CANYYY
53468 (+) S01598 CATTAGTG
53302 (+) S01616 CATTW
53468 (+) S01616 CATTW
53462 (-) S01616 CATTW
53385 (+) S01003 CCCAG
53349 (-) S01703 CMGTTR
53354 (-) S01197 CTATTC
53340 (-) S01144 CTCATGA
53321 (-) S01144 CTCATGA
53295 (-) S00794 CTTTCC
53316 (+) S01622 CWKKANNY
53380 (-) S01622 CWKKANNY
53263 (-) S01622 CWKKANNY
53393 (-) S00973 GAGGC
53436 (+) S01544 GSSWGSCC
53442 (-) S01544 GSSWGSCC
53234 (+) S02023 MAMAG
53284 (+) S02023 MAMAG
53504 (+) S02023 MAMAG
53428 (-) S02023 MAMAG
53411 (-) S02023 MAMAG
53498 (-) S00477 MYWATCWY
53501 (+) S00087 TATAAA
53501 (+) S00615 TATAAAA
53501 (+) S01540 TATAWAW
53524 (+) S00484 TATCTC
53317 (-) S01424 TGANTMA
53485 (-) S02137 TGGCA
53355 (+) S01375 TGGGC
53434 (+) S01375 TGGGC
53409 (+) S02000 TKNNGNAAK
53409 (+) S00121 TKNNGYAAK
53351 (-) S00563 TNNAKYNNKNNMTNATGA
53381 (-) S02121 WCTGG
53398 (-) S00487 WCTRG
53381 (-) S00487 WCTRG
53528 (-) S00381 WGATAR
53344 (+) S01896 YAACKG
for promoter at position - 14043
13972 (+) S01153 AARKGA
13910 (-) S01153 AARKGA
13953 (+) S02066 AGATTTTTC
13791 (+) S00089 CANYYY
13798 (+) S00089 CANYYY
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14002 (-) S00089 CANYYY
13756 (-) S00089 CANYYY
14034 (+) S01616 CATTW
14002 (-) S01616 CATTW
13793 (-) S00252 CTGATTA
13882 (-) S01622 CWKKANNY
13961 (-) S02065 GAAAAATCT
13854 (-) S00742 GGTCC
13854 (+) S02023 MAMAG
13971 (+) S02023 MAMAG
13781 (-) S02023 MAMAG
14014 (+) S00087 TATAAA
14014 (+) S00615 TATAAAA
14014 (+) S01540 TATAWAW
13919 (+) S01424 TGANTMA
13792 (-) S01424 TGANTMA
13881 (+) S02137 TGGCA
13814 (+) S01937 TGTGGWWW
13879 (+) S02121 WCTGG
13761 (+) S00487 WCTRG
13808 (+) S00487 WCTRG
13879 (+) S00487 WCTRG
13982 (+) S00487 WCTRG
14039 (+) S00487 WCTRG
13987 (-) S00487 WCTRG
13813 (-) S00487 WCTRG
13914 (-) S00381 WGATAR
13925 (-) S00018 WTATYCAT
for promoter at position - 69328
69203 (+) S01152 AAGTGA
69203 (+) S01153 AARKGA
69124 (+) S01090 AATGA
69128 (+) S00922 AGAGG
69238 (+) S00922 AGAGG
69258 (-) S00922 AGAGG
69293 (+) S00099 AGCCACT
69256 (-) S00392 AGGAAG
69028 (-) S00392 AGGAAG
69216 (-) S01946 ANATGG
69126 (-) S00880 ATTGG
69279 (+) S00089 CANYYY
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69244 (-) S00089 CANYYY
69207 (-) S00089 CANYYY
69167 (-) S00089 CANYYY
69134 (-) S00089 CANYYY
69067 (-) S00089 CANYYY
69212 (+) S00537 CATGTGGC
69279 (+) S01616 CATTW
69122 (+) S00633 CCAAT
69045 (+) S01003 CCCAG
69164 (-) S01003 CCCAG
69098 (+) S00040 CCTGC
69056 (-) S00040 CCTGC
69200 (+) S01954 CGGAAGTG
69061 (-) S01462 CTGAGCCTG
69042 (-) S00794 CTTTCC
69257 (-) S01502 GAGGAA
69272 (+) S00856 GCACTC
69269 (+) S00974 GGGGC
69123 (-) S01193 GGGNGGRR
69042 (+) S00742 GGTCC
69085 (+) S00909 GTTTTAA
69094 (-) S00909 GTTTTAA
69188 (+) S02023 MAMAG
69223 (+) S02023 MAMAG
69268 (-) S02023 MAMAG
69143 (-) S02023 MAMAG
69075 (-) S02023 MAMAG
69198 (+) S01770 RNMGGAWGT
69091 (+) S02095 RRRCWWGYYY
69100 (-) S02095 RRRCWWGYYY
69177 (+) S01190 RYYWSGTG
69257 (-) S02024 SAGGAAGY
69137 (-) S00258 SCCCACCTC
69299 (+) S01540 TATAWAW
69199 (-) S00262 TCNTACTC
69175 (+) S02100 TGASTAG
69322 (-) S02137 TGGCA
69213 (-) S02137 TGGCA
69133 (+) S01375 TGGGC
69166 (+) S00864 TGTCCT
69034 (+) S02000 TKNNGNAAK
69087 (+) S01052 TTTAAA
69092 (-) S01052 TTTAAA
69109 (+) S02121 WCTGG
69159 (+) S02121 WCTGG
69050 (-) S02121 WCTGG
69109 (+) S00487 WCTRG
69159 (+) S00487 WCTRG
69177 (+) S00487 WCTRG
69050 (-) S00487 WCTRG
69243 (+) S00381 WGATAR
for promoter at position - 104929
104819 (-) S01152 AAGTGA
104819 (-) S01153 AARKGA
104875 (+) S01090 AATGA
104745 (+) S00595 AATTACAT
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104877 (-) S00880 ATTGG
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104779 (+) S00089 CANYYY
104815 (+) S00089 CANYYY
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104810 (-) S00089 CANYYY
104750 (+) S01616 CATTW
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104709 (+) S01003 CCCAG
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104920 (+) S01622 CWKKANNY
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104808 (-) S01622 CWKKANNY
104878 (+) S00038 GAACAG
104886 (+) S01502 GAGGAA
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104800 (-) S01089 GCCAA
104832 (+) S02023 MAMAG
104879 (+) S02023 MAMAG
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104647 (-) S02023 MAMAG
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104683 (-) S00435 TACAAA
104901 (+) S00087 TATAAA
104901 (+) S00615 TATAAAA
104901 (+) S01540 TATAWAW
104922 (+) S01059 TGACGT
104672 (+) S01458 TGAGACTT
104797 (+) S02137 TGGCA
104833 (-) S02137 TGGCA
104869 (-) S01937 TGTGGWWW
104811 (+) S01038 TGTTCACT
104739 (+) S02000 TKNNGNAAK
104739 (+) S00121 TKNNGYAAK
104764 (+) S01974 TRTTTGY
104801 (+) S00381 WGATAR
for promoter at position - 28428
28155 (+) S00098 AACCAAT
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28233 (+) S01090 AATGA
28147 (+) S01013 ACAGCTG
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28133 (-) S00089 CANYYY
28229 (+) S01616 CATTW
28236 (-) S01616 CATTW
28211 (-) S01616 CATTW
28157 (+) S00633 CCAAT
28174 (+) S01971 CTGGRAA
28174 (+) S01622 CWKKANNY
28247 (+) S01622 CWKKANNY
28265 (+) S01622 CWKKANNY
28404 (-) S01622 CWKKANNY
28382 (-) S01622 CWKKANNY
28264 (-) S01622 CWKKANNY
28382 (+) S00090 GAGAGGA
28384 (+) S01502 GAGGAA
28167 (-) S01909 GAGGTC
28277 (+) S02023 MAMAG
28300 (+) S02023 MAMAG
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28362 (+) S02023 MAMAG
28407 (+) S02023 MAMAG
28422 (+) S02023 MAMAG
28417 (-) S02023 MAMAG
28147 (+) S01950 RCAGNTG
28313 (+) S02095 RRRCWWGYYY
28322 (-) S02095 RRRCWWGYYY
28397 (+) S01205 SWATWWAG
28272 (-) S01205 SWATWWAG
28291 (+) S00435 TACAAA
28398 (+) S00087 TATAAA
28186 (+) S00485 TCATCAC
28213 (+) S01426 TGACTCA
28213 (+) S01450 TGACTCAGC
28213 (+) S01424 TGANTMA
28219 (-) S01424 TGANTMA
28213 (+) S01935 TGASTMA
28219 (-) S01935 TGASTMA
28137 (+) S01037 TGTTCT
28219 (-) S01595 TKAGTCA
28341 (+) S02000 TKNNGNAAK
28259 (-) S02000 TKNNGNAAK
28271 (+) S02121 WCTGG
28130 (-) S02121 WCTGG
28271 (+) S00487 WCTRG
28130 (-) S00487 WCTRG
You could find helpful this tutorial is at https://www.embl-heidelberg.de/~seqanal/cou...enePred.00.html
But TSSG has changed here https://www.softberry.ru/berry.phtml?group=...&topic=tssg,
Hope it helps